Tez Dosyaları

1999 - 2007

Doktora

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik (Dr), Türkiye

1997 - 1999

Yüksek Lisans

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik (Yl) (Tezli), Türkiye

1992 - 1996

Lisans

Yarmouk University, Ürdün

2006

Doktora

Identification of novel genetic elements controlling transcriptional regulation of the human Na/I- symporter (NIS) gene

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik (Dr)

1999

Yüksek Lisans

Nf1 mutation analysis in a patient homozygous for a truncating hmlh1 mutation

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Ve Genetik (Yl) (Tezli)

C2 Ustalık

Arapça

C2 Ustalık

İngilizce

2018 - Devam Ediyor

Doç. Dr.

Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü, Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Anabilim Dalı

2014 - 2018

Yrd. Doç. Dr.

Dokuz Eylül Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü

2025 - Devam Ediyor

Anabilim/Bilim Dalı Başkanı

Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp Ve Genom Enstitüsü, Biyotıp Ve Sağlık Teknolojileri Anabilim Dalı

2024 - Devam Ediyor

Enstitü Yönetim Kurulu Üyesi

Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü

2022 - Devam Ediyor

İntibak/Muafiyet Komisyonu Üyesi

Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü

Doktora

Specialized Field

Epigenetics

SPECİALİZED FİELD

Methods in Gene Regulation

Chromatin and Transcription

Recombinant DNA Technologies (Teorik)

THESİS

UZMANLIK ALANI

Moleküler Biyoloji ve Hücre Biyolojisi Yöntemleri II

Moleküler Biyoloji ve Hücre Biyolojisi Yöntemleri I

Yüksek Lisans

SPECİALİZED FİELD

Specialized Field

Laboratory Techniques in Molecular Biology

THESİS

Genetics and Genomics

UZMANLIK ALANI

Tez çalışması

Kanserin Moleküler Temelleri

TEMEL MOLEKÜLER BİYOLOJİ YÖNTEMLERİ I

Lisans

ÜGE 1102 Blok 2- Ürogenital-Endokrin 101 (Probleme Dayalı Öğrenme (PDÖ)

SDK 1104 Blok 4-Solunum-Dolaşım-Kan 101 (Probleme Dayalı Öğrenme (PDÖ)

DERİ LOKOMOTOR 1202+BYA2201 LOKOMOTOR DERİ101+BYA201(ÖCM)

KEB201+ GBM201- KEB201+GBM201 (ÖÇM)

SİNİR BİLİMLERİ BLOĞU 101 (ÖÇM)

TBG 1101 Blok 1 2014-2015- Tıp Bilimlerine Giriş 101 (Sunum+Uygulama)

TBG 2203 TBG 201 (Özel Çalışma Modülü (ÖÇM))

2025

Doktora

Epıgenetıc regulatıon of epıthelıal to mesenchymal transıtıon by hıstone varıant H3.3

Alotaibi H. (Danışman)

E.ŞEKEROĞLU(Öğrenci)

2024

Yüksek Lisans

Investigation of functional contribution of H1E In EMT and MET

Alotaibi H. (Danışman)

G.IMPRAIMOGLOU(Öğrenci)

2024

Yüksek Lisans

Mezenkimal epitelyal dönüşüm sürecinde kritik olan uzun kodlamayan RNA'ların işlevsel analizleri

ALOTAİBİ H. (Danışman)

A.ÖZKAN(Öğrenci)

2024

Yüksek Lisans

Mezenkimal epitelyal dönüşümün epigenetiği

ALOTAİBİ H. (Danışman)

İ.YAPRAK(Öğrenci)

2024

Yüksek Lisans

EPIGENETICS OF THE MESENCHYMAL TO EPITHELIAL TRANSITION

Alotaibi H. (Danışman)

İ.Yaprak(Öğrenci)

2024

Doktora

regulaTER: an R package for analysis of transposable elements in accessible regions

Alotaibi H. (Eş Danışman), Karakülah G.

D.ESKİER(Öğrenci)

2024

Yüksek Lisans

Analysis of long non-coding RNAs in epithelial-mesenchymal transition and mesenchymal-epithelial transition processes: Comparative synteny analysis between human and mouse genomes

Alotaibi H. (Eş Danışman), Karakülah G.

E.YILDIZ(Öğrenci)

2023

Doktora

DNA repair in rahman syndrome

Yağcı T., Alotaibi H. (Eş Danışman)

A.ALKAREM(Öğrenci)

2023

Yüksek Lisans

Functional Analysis of Long Non-coding RNAs Critical for the Mesenchymal to Epithelial Transition

Alotaibi H. (Danışman)

A.ÖZKAN(Öğrenci)

2023

Yüksek Lisans

Investigation of the role of extracellular matrix and tumor microenvironment keratan sulfate proteoglycan composition in cancer metastasis

ALOTAİBİ H. (Eş Danışman), ÇAKAN AKDOĞAN G. (Eş Danışman)

E.ERSÖZ(Öğrenci)

2023

Yüksek Lisans

Mezenkimal epitelyal dönüşüm sürecinde ELF3 ve DNA metil transferazların etkileşimleri

ALOTAİBİ H. (Danışman)

S.YETKİN(Öğrenci)

2023

Yüksek Lisans

Interactions of ELF3 and DNA methyl transferases in mesenchymal epithelial transformation

Alotaibi H. (Danışman)

S.YETKİN(Öğrenci)

2023

Yüksek Lisans

Tümör mikroçevresi ve hücre dışı matriks keratan sülfat proteoglikan kompozisyonun kanser metastazındaki rolünün araştırılması

ALOTAİBİ H. (Eş Danışman), ÇAKAN AKDOĞAN G. (Eş Danışman)

E.ERSÖZ(Öğrenci)

2021

Yüksek Lisans

Identification of Grhl3 Target Genes during the Mesenchymal to Epithelial Transition

Sawafta A., Alotaibi H. (Eş Danışman)

D.A.(Öğrenci)

2020

Yüksek Lisans

Elf3 regulated transcriptome dynamics during mesenchymal to epithelial transition

KARAKÜLAH G. (Eş Danışman), ALOTAİBİ H. (Eş Danışman)

H.UZUNER(Öğrenci)

2020

Yüksek Lisans

Transcriptional impact of TGFβ on epithelial-mesenchymal transition

ALOTAİBİ H. (Danışman)

H.AYTEKİN(Öğrenci)

2020

Doktora

Identification of transcriptional networks controlling themesenchymal-epithelial transition

ALOTAİBİ H. (Danışman)

B.ŞENGEZ(Öğrenci)

2019

Yüksek Lisans

Transcriptional regulation of ccaat enhancer binding protein alpha (CEBPA)

ALOTAİBİ H. (Danışman)

Ç.BULDU(Öğrenci)

2019

Yüksek Lisans

The role of C-met activation on the organ specific extravasation in hepatocellular carcinoma cells

ALOTAİBİ H. (Eş Danışman), ATABEY S. N. (Eş Danışman)

G.BAĞCI(Öğrenci)

2019

Yüksek Lisans

Identification and annotation of putative long noncoding RNAs involved in mesenchymal-epithelial transition

ALOTAİBİ H. (Eş Danışman), KARAKÜLAH G. (Eş Danışman)

D.ESKİER(Öğrenci)

2016

Yüksek Lisans

Memeli grainy head-like 3 (Grhl3) promotör bölgesinin işlevsel tanımı

ALOTAİBİ H. (Danışman)

İ.AYGÜN(Öğrenci)

2023

Eskier D., Yetkin S., Arslan N., Erkek S., ALOTAİBİ H., KARAKÜLAH G.

14. Türk Tıp Bilişimi Kongresi, İzmir, Türkiye, 16 - 18 Mart 2023, (Özet Bildiri)

2022

Yıldız Ş. N., Özkuru E., ALOTAİBİ H., Dimitrov S.

International Biochemistry Congress 2022, Türkiye, 27 - 29 Ekim 2022, (Özet Bildiri)

2022

Özkuru E., Yıldız Ş. N., ALOTAİBİ H., Dimitrov S.

International Biochemistry Congress 2022, Türkiye, 27 - 29 Ekim 2022, (Özet Bildiri)

2022

Yıldız Ş. N., Özkuru E., Kutlu N. K., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H., Dimitrov S.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey (MolBiyoKon’22), Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

2022

Özkuru E., Yıldız Ş. N., Kutlu N. K., KARAKÜLAH G., Dimitrov S., ALOTAİBİ H.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey (MolBiyoKon’22), İstanbul, Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

2022

Batur T., Argundogan A., Mutlu Z., KELEŞ U., ALOTAİBİ H., ŞENTÜRK Ş., et al.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

2022

Özkan A., Eskier D., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

2021

Aytekin H., ALOTAİBİ H.

IV International Conference on Data Science and Applications (ICONDATA’21), Online, Türkiye, 4 Haziran - 06 Eylül 2021, (Tam Metin Bildiri)

2021

Aytekin H., ALOTAİBİ H.

2nd International Şişli Science Congress, İstanbul, Türkiye, 27 - 28 Mayıs 2021, ss.135-149, (Tam Metin Bildiri)

2019

Şengez B., Arslan N., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

Onkolojide İz Bırakanlar Zirvesi, Türkiye, 14 - 16 Kasım 2019, ss.23, (Özet Bildiri)

2019

Şengez B., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

Hezarfen Uluslararası Fen Matematik ve Mühendislik Bilimleri Kongresi, İzmir, Türkiye, 8 - 10 Kasım 2019, ss.1007, (Tam Metin Bildiri)

2019

Şengez B., Arslan N., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

12. Tıp Bilişimi Kongresi, Ankara, Türkiye, 15 - 16 Kasım 2019, ss.30-36, (Tam Metin Bildiri)

2019

Şengez B., ALOTAİBİ H.

First International Multidisciplinary Cancer Research Congress, Diyarbakır, Türkiye, 18 - 22 Eylül 2019, (Özet Bildiri)

2019

Şengez B., ALOTAİBİ H.

14th Annual EORTC PathoBiology Group Meeting, İstanbul, Türkiye, 12 - 14 Eylül 2019, (Özet Bildiri)

2018

Şengez B., ALOTAİBİ H.

MOKADMOKAD 2018 - 7. Multidisipliner Kanser Araştırma Kongresi, İzmir, Türkiye, 11 - 14 Ekim 2018, (Özet Bildiri)

2018

ESKİER D., ŞENGEZ B., ALOTAİBİ H., KARAKÜLAH G.

MOLBİYOLKON 2018 - 6th Interational Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, 6 - 08 Eylül 2018, (Özet Bildiri)

2017

Aygün İ., Şengez B., Tercan Avcı S., ALOTAİBİ H.

5th International Congress of the Molecular Biology and Genetics Association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 8 - 10 Eylül 2017, (Özet Bildiri)

2017

İŞCAN E., Ekin U., ALOTAİBİ H., ÖZTÜRK M.

1. Çukurova hepatoselüler karsinoma sempozyomu, Türkiye, 10 - 12 Şubat 2017, (Özet Bildiri)

2016

Şengez B., Aygün İ., ALOTAİBİ H.

6th Multidisciplinary Cancer Research Congress, Konya, Türkiye, 27 - 29 Ekim 2016, (Özet Bildiri)

2016

Ekin U., Iscan E., Logotheti S., Nikos K., Alotaibi H., Ferroudj S., et al.

41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.163, (Özet Bildiri)

2016

Iscan E., Ekin U., Zoumpourlis V., Nikos K., Alotaibi H., Nekulova M., et al.

41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.163, (Özet Bildiri)

2014

ALOTAİBİ H., Basilicata F., KONU KARAKAYALI Ö., Kosowan T., Schreck I., Braeutigam C., et al.

11th EMBL Conference: Transcription and Chromatin, 23 - 26 Ağustos 2014, (Özet Bildiri)

2013

TELKOPARAN AKILLILAR P., Erkek S., Yaman E., ALOTAİBİ H., Bayık D., TAZEBAY U. H.

XIII. ULUSAL TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK KONGRESİ, Türkiye, 27 - 30 Ekim 2013, (Özet Bildiri)

2006

ALOTAİBİ H., Yaman E., DEMİRPENÇE E., TAZEBAY U. H.

The 6th ISREC Conference on Cancer Research, Lausanne, İsviçre, 10 - 13 Ekim 2006, (Özet Bildiri)

2006

Cankaya E. Y., Alotaibi H., Demirpence E., Tazebay U. H.

31st Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS), İstanbul, Türkiye, 24 - 29 Haziran 2006, cilt.273, ss.86, (Özet Bildiri)

2000

ALOTAİBİ H.

The 10th International Clinical Genetics Seminar, 20 - 24 Ekim 2000, (Özet Bildiri)

1999

ALOTAİBİ H., Ricciardone M. D.

Molecular Mechanisms of SignalTransduction, a NATO/FEBS Summer School, Spetses, Yunanistan, 16 - 18 Ağustos 1999, (Özet Bildiri)

2021

Arslan M., Kaleli N. E., Karadağ M., Yarımçam M. C., KALYONCU UZUNLAR S., ALOTAİBİ H.

PROTEİN: YAPISI, MÜHENDİSLİĞİ, ETKİLEŞİMLERİ, DİNAMİĞİ VE İLAÇ TASARIMINDAKİ YERİ, SALİHA ECE ACUNER, Editör, Ankara Nobel Tıp Kitabevleri, Ankara, ss.115-134, 2021

2021

Aytekin H., ALOTAİBİ H.

Research & Reviews in Health Sciences, CEM EVEREKLİOĞLU, Editör, Gece Kitaplığı, ss.135-150, 2021

2016

Alotaibi H., Atabey S. N., Diril M. K., Erdal Bağrıyanık Ş. E., Öztürk M.

Hepatocellular Carcinoma Diagnosis and Treatment, Brian I Carr, Editör, Springer International Publishing, Zürich, ss.43-63, 2016

2023 - Devam Ediyor

Kanser ve metastaz oluşumunda Elf5 genin rolünün, E-cadherin üzerindeki regülasyonu ve EMT/MET kontrol mekanizmasının araştırılması.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

ALOTAİBİ H. (Yürütücü), SAĞIR H., YAPRAK İ., KARAKÜLAH G., BÜYÜKKILIÇ Ş.

2025 - 2028

Pankreas Kanserinde MECOM'un Biyobelirteç Olarak Tanımlanması ve MECOM İfadesine Bağlı Pankreas Kanseri Hücrelerinde Epigenetik İnhibitör Yanıtının Belirlenmesi

TÜBİTAK - AB COST Projesi

Erkek Özhan S. (Yürütücü), Karakülah G., Sağol Ö., Aysal Ağalar A., Ağalar C., Ünek İ. T., et al.

2025 - 2027

TNBC de NRF2-miRNA-Hedef Gen Ekseninin Transkriptomik ve Epigenetik Yaklaşımlarla İncelenmesi

TÜBİTAK - AB COST Projesi

Alotaibi H., Bitirim C. V., Telkoparan Akıllılar P.(Yürütücü)

2024 - 2027

Mezenkimal-Epitelyal Dönüşümde C730027H18Rik Geninin Rolü: MET Düzenlemesine Yeni Bir Bakış

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Alotaibi H. (Yürütücü), Karakülah G.

2023 - 2027

Korunma ve Tedavi Ulusal Platformu

TÜBİTAK Projesi , 1004 – Mükemmeliyet Merkezi Destek Programı FAZ II

Koçer Z. A., Diril M. K., Alotaibi H.

2023 - 2026

Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Rol Alan Mikrorna'Ların Tanımlanması Ve Fonksiyonel Analizleri

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Alotaibi H. (Yürütücü), Karakülah G.

2023 - 2025

Meme Kanseri MCF-7 Hücre modelinde ZEB1 ile İndüklenen EMT/MET Süreçlerindeki Kritik LncRNA’ların Tanımlanması ve Fonksiyonel Analizleri

TÜSEB B Grubu AR-GE Projesi

Alotaibi H. (Yürütücü), Karakülah G.

2022 - 2024

Sağlıkta ve Rahman Sendromunda Bağlayıcı Histon H1E

TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi , 2502 - Bulgaristan Bilimler Akademisi (BAS) İkili İşbirliği Programı

Diril M. K., Alotaibi H., Lone I. N., Anguelov D., Dimitrov S. I.

2021 - 2024

Mezenkimal Epitelyal Dönüşümün Epigenetiği

TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi , 2509 - Fransa Dışişleri Bakanlığı ile Bosphorus Programı

Alotaibi H. (Yürütücü), Karakülah G.

2022 - 2023

Desminin kromatine ile etkileşiminin araştırılması

TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı

Alotaibi H. (Yürütücü), Dinçer P. R.

2021 - 2023

Gen Düzenleyici Rolleri Olan Transpozonların Tahminlenmesine Yönelik Bir Biyoinformatik Araç Geliştirilmesi Ve Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Yer Alan Transpozonların Belirlenmesi

TÜBİTAK Projesi , 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı

Alotaibi H., Karakülah G. (Yürütücü), Erkek Özhan S.

2020 - 2023

Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Kritik Olan Uzun Kodlamayan RNA’ların İşlevsel Analizleri

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Alotaibi H. (Yürütücü), Karakülah G.

2020 - 2022

Hepatoselüler Karsinoma Hücre Hatlarının Doksorubisin Hassasiyetini Arttırmaya Yönelik TOLLIP Geninin Doksorubisin Dirençliliğindeki Rolünün Belirlenmesi

TÜBİTAK Projesi , 3501 - Ulusal Genç Araştırmacı Kariyer Geliştirme Programı

Alotaibi H., Demir A. B.(Yürütücü)

2019 - 2022

Epigenetics of Epithelial-to-Mesenchymal and Mesenchymal-to-Epithelial Transitions : Role of Histone Variants and Pioneer Transcription Factors

TÜBİTAK Projesi , 2232 - Yurda Dönüş Araştırma Burs Programı

Alotaibi H., Dimitrov S.(Yürütücü), Karaca Erek E.

2016 - 2022

Kanser ve Osteoporoz Tedavisi İçin Monoklonal Antikor Etkin Maddeli Biyobenzer İlaç Geliştirilmesi ve Üretilmesi

TÜBİTAK Projesi , 1007 - Kamu Kurumları Araştırma ve Geliştirme Projelerini D.P.

Ayar Kayalı H. (Yürütücü), Tunçok Y., Bağrıyanık H. A., Alotaibi H., Güneli M. E., Diril M. K., et al.

2017 - 2021

Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm (MET) Sürecinde Epigenetik Yeniden Programlamayı Etkileyen Transkripsiyon Faktörlerinin Belirlenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Alotaibi H. (Yürütücü), Karakülah G.

2014 - 2018

Mezenkimal Epitelyal Dönüşümünü Met Kontrol Eden Transkripsiyonel Ağların Belirlenmesi

TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

Alotaibi H. (Yürütücü)

2014 - 2016

Mezenkimal Epiteliyal Süreçinde ELF3 nün Grhl3 Ekspresyonuna Olan Etkisinin Belirlenmesi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

Alotaibi H. (Yürütücü)

2024 - Devam Ediyor

Biomedicine and Genome Research

Baş Editör

2023 - Devam Ediyor

FRONTIERS IN CELL AND DEVELOPMENTAL BIOLOGY

Editör

2000 - Devam Ediyor

Biochemical Society

Üye

Ağustos 2023

GENOME RESEARCH

SCI-E Kapsamındaki Dergi

Ağustos 2023

FRONTIERS IN CELL AND DEVELOPMENTAL BIOLOGY

SCI-E Kapsamındaki Dergi

Nisan 2023

NUCLEIC ACIDS RESEARCH

SCI-E Kapsamındaki Dergi

Kasım 2021

JOURNAL OF GASTROINTESTINAL CANCER

SCI-E Kapsamındaki Dergi

Ağustos 2020

COMMUNICATIONS BIOLOGY

SCI-E Kapsamındaki Dergi

Şubat 2015

MUTATION RESEARCH - FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS

SCI-E Kapsamındaki Dergi

Kasım 2023

TÜBİTAK Projesi

1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı, TÜBİTAK, Türkiye

Ekim 2023

TÜBİTAK Projesi

1002 - Hızlı Destek Programı, TÜBİTAK, Türkiye

Ekim 2023

TÜBİTAK Projesi

1002 - Hızlı Destek Programı, TÜBİTAK, Türkiye

Ağustos 2023

TÜBİTAK Projesi

1002 - Hızlı Destek Programı, TÜBİTAK, Türkiye

Mart 2023

TÜBİTAK Projesi

1002 - Hızlı Destek Programı, TÜBİTAK, Türkiye