Mezenkimal epitelyal dönüşüm sürecinde kritik olan uzun kodlamayan RNA'ların işlevsel analizleri


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü, Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Ana Bilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: AYÇA ÖZKAN

Danışman: HANİ ALOTAİBİ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Epitelyal-mezenkimal dönüşüm (EMT) ve mezenkimal-epitelyal geçiş (MET), normal gelişim, yara iyileşmesi ve tümör oluşumu gibi çeşitli fizyolojik ve patolojik süreçler için çok önemli olan farklı biyolojik olaylardır. Daha önce MET, yalnızca EMT'nin tersinir bir süreci olarak görülüyordu; MET düzenlemesinden sorumlu olduğu düşünülen EMT'yi indükleyen faktörlerin ekspresyonu azalmıştı. Ayrıca EMT'de kodlamayan RNA'larla ilgili bazı yayınlar olmasına rağmen MET ile ilgili lncRNA'larla ilgili yayınlarda hala eksiklikler mevcut. EMT sürecine benzer şekilde MET düzenlemesindeki potansiyel rollerini gösteren MET ile ilişkili yeni lncRNA'lar vardır. Bu tezde amaç MET için kritik olan lncRNA'ları tanımlamaktı. Yüksek verimli veri üretimi, gen modülasyonu ve biyoinformatik içeren entegre bir yaklaşım kullandık; sonuçlarımız MET ile ilişkili lncRNA'ların hücre döngüsünde, kromozom ayrımında, DNA hasarı onarımında önemli roller oynadığını ve MET'i kontrol eden düzenleyici bir ağa katkıda bulunduğunu gösteriyor. Deneylerimizden NH.3067, MET'in kritik başlatıcısı olarak ortaya çıktı ve gelişmiş deneyler yoluyla daha fazla araştırması gerekiyor. Düzenleyici rollerinin ötesinde, bu lncRNA'lar potansiyel kanser biyobelirteçleri olarak umut vaat ediyor. Anahtar kelimeler: MET, EMT, lncRNA, Transkripsiyon