Investigation of functional contribution of H1E In EMT and MET


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü, Genom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: GKAMZE IMPRAIMOGLOU KAFAZ

Danışman: Hani Alotaibi

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Epitelyal mezenkimal dönüşüm (EMT) ve mezenkimal epitelyal dönüşüm (MET) süreçleri normal gelişim, yara iyileşmesi ve tümorigenez gibi birçok önemli fizyolojik ve patolojik süreç açısından önem taşıyan farklı iki biyolojik olaydır. Bu süreçler genomik düzeyde bir değişikliğe neden olmaksızın, hücre kimliğini bütünsel olarak değiştirmektedir. Bu değişim epigenetik mekanizmalar ile düzenlenmektedir. Başlıca epigenetik düzenlemelerden biri olan kromatin konformasyonu; ökaryotik hücrelerde DNA'nın kromatine katlanmasını sağlayan, pozitif yüklü proteinler olan histon etkileşimleriyle modüle edilir. Kromatin, küçük bir DNA parçası, bağlayıcı histon ve kor histon oktamer kompleksinden oluşan nükleozom adlı yapının tekrarlarından oluşup konformasyonel statüsüne bağlı olarak gen ifadesini regüle etmektedir. H1E bağlayıcı histon H1 ailesinin bir üyesi ve replikasyon bağımlı histonları alt grubunun bir üyesi olup, yokluğunda hücre proliferasyonun negatif etkilendiği tespit edilmiştir. Bunun yanı sıra bu gendeki protein doz düşümüne veya hatalı protein üretimine sebebiyet veren mutasyonların beyin başta olmak üzere bazı organların gelişim ve fonksiyon bozukluklarına neden olduğu tespit edilmiş ve otizm spektrum bozukluğu ile ilişkilendirilmiş, spesifik bir C-terminal mutasyonu bireylerde gösterdiği ortak fenotip ve klinik tablo ile Rahman sendromu olarak tanımlanmıştır. H1E proteininin disregülasyonunun gelişimsel süreçler üzerindeki negatif etkisi tespit edilmiş olmasına rağmen, EMT ve MET üzerinde ki etkileri ve etki mekanizması karanlıkta bırakılmıştır. Bu çalışma, Rahman Sendromunda gözlemlenen patojenik H1E varyantının varlığı ve H1E yokluğuna odaklanarak EMT ve MET'teki fonksiyonel rollerini araştırmayı amaçlamıştır.