Prof. Dr. GÖKHAN KARAKÜLAH

KLINIK PSIKOFARMAKOLOJI BULTENI-BULLETIN OF CLINICAL PSYCHOPHARMACOLOGY , cilt.24, sa.3, ss.235-247, 2014 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin) Sürdürülebilir Kalkınma

88. Computer Based Extraction of Phenoptypic Features of Human Congenital Anomalies from the Digital Literature with Natural Language Processing Techniques

KARAKÜLAH G., DİCLE O., SÜMER A., KOŞANER Ö., BİRANT Ç. C., BERBER T., et al.

Studies in Health Technology and Informatics , cilt.205, ss.570-574, 2014 (Scopus)

89. Towards a Web-Based Decision Support Tool for Selecting Appropriate Statistical Test in Medical and Biological Sciences

SÜMER A., KARAKÜLAH G., DİCLE O.

Studies in Health Technology and Informatics , cilt.205, ss.48-52, 2014 (Scopus)

90. Early Biventricular Molecular Responses to an Acute Myocardial Infarction

Erdal C., KARAKÜLAH G., Fermanci E., Kunter I., Silistreli E. E., Canda T., et al.

INTERNATIONAL JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES , cilt.9, sa.1, ss.74-82, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

91. Genome-Wide Gene Expression Analysis of NIH 3T3 Cell Line Under Mechanical Stimulation

Demirci E. K., Demirci T., Trzewik J., Linder P., KARAKÜLAH G., Artmann G. M., et al.

CELLULAR AND MOLECULAR BIOENGINEERING , cilt.4, sa.1, ss.46-55, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)

92. mESAdb: microRNA Expression and Sequence Analysis Database

Kaya K. D., KARAKÜLAH G., Yakicier C. M., ACAR A. C., KONU KARAKAYALI Ö.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH , cilt.39, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler 48

1. Protein truncating mutation occurring in C-terminus of FYR domain of Kabuki Syndrome-Associated KMT2D gene causes major changes in chromatin organization

Özden Yılmaz G., Ölmez Türker A., Yılmazbilek İ., KARAKÜLAH G., OKTAY Y., GENÇPINAR P., et al.

17th Annual ICORD Meeting, 14 Kasım 2025, (Özet Bildiri)

2. Enhancing genomic data sharing with blockchain-enabled dynamic consent in Beacon v2

Binokay L., Celik H. M., Gurdal G., Ayav T., Tuglular T., OKTAY Y., et al.

57th Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG), Berlin, Almanya, 1 - 04 Haziran 2024, cilt.32, ss.1635-1636, (Özet Bildiri)

3. Enhancing genomic data sharing with blockchainenabled dynamic consent in Beacon v2

Binokay L., Celik H. M., Gurdal G., Ayav T., Tuglular T., OKTAY Y., et al.

57th Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG), Berlin, Almanya, 1 - 04 Haziran 2024, cilt.32, ss.1635-1636, (Özet Bildiri)

4. Comprehensive In Vivo Characterization of a Novel Rare Genetic Disease

S. K., ESMEN K., KÖSE T. B., SEVER BAHÇEKAPILI M., EREN KOÇAK E., DEMİR YÜKSEL Ş., et al.

GALEN MEDICINE DAYS-2024, PRECISION MEDICINE IN HEALTH AND DISEASE INTERNATIONAL SYMPOSIUM, İzmir, Türkiye, 3 - 04 Ekim 2024, cilt.4, (Özet Bildiri)

5. Investigation of the Effects of Mutations in the FYR Module of Kabuki Syndrome-Associated KMT2D Gene on Protein Interactions and Chromatin Organization

Özden Yılmaz G., Yılmazbilek İ., Ölmez Türker A., Ozkan Kucuk N. E., ÖZLÜ SICAKKAN N., KARAKÜLAH G., et al.

9th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, İzmir, Türkiye, 12 - 14 Eylül 2024, (Özet Bildiri)

6. Investigating the molecular mechanism of tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand-induced macrophage polarization: Transcriptomic analysis of key signaling molecules

Songoren S., Gunalp S., Bursali A., KARAKÜLAH G., SAĞ D.

7th European Conference of Immunology, Dublin, İrlanda, 1 - 04 Eylül 2024, cilt.54, ss.1297, (Özet Bildiri)

7. Escape from TGF-β-induced Senescence Promotes Aggressive Cancer Hallmarks in Epithelial Hepatocellular Carcinoma Cells

Kalyoncu M., Demirci D., ERİŞ S., Uluata Dayanç B., ÇAKIROĞLU E., BAŞOL M., et al.

The 2024 Annual Congress of the European Association for Cancer Research (EACR 2024), Rotterdam, Hollanda, 10 - 13 Haziran 2024, cilt.18, ss.347-348, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

8. Pooled CRISPR Screening Identifies AP-1 Transcription Factor as a Druggable Driver of Osimertinib Resistance in Non-Small Cell Lung Cancer

ULUATA DAYANÇ B., ERİŞ S., ÇAKIROĞLU E., Özden Yılmaz G., Gülfırat N. E., Coşkun Ö. Ş., et al.

The 2024 Annual Congress of the European Association for Cancer Research (EACR 2024), Rotterdam, Hollanda, 10 - 13 Haziran 2024, cilt.18, ss.224, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

9. Genome-wide CRISPR Screening Identifies RUVBL1/2 Complex as a Druggable Vulnerability in Bladder Cancer

AKDEMİR B., ERİŞ S., Kalyoncu M., ÇAKIROĞLU E., Coşkun Ö. Ş., KARAKÜLAH G., et al.

The 2024 Annual Congress of the European Association for Cancer Research (EACR 2024), Rotterdam, Hollanda, 10 - 13 Haziran 2024, cilt.18, ss.180-181, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

10. Genome-Wide CRISPR Screens: Unveiling BUB1 Kinase as a Druggable Vulnerability in Malignant Pleural Mesothelioma

ÇAKIROĞLU E., ERİŞ S., Öz Ö., KARAKÜLAH G., ŞENTÜRK Ş.

The 2024 Annual Congress of the European Association for Cancer Research (EACR 2024), Rotterdam, Hollanda, 10 - 13 Haziran 2024, cilt.18, ss.183-184, (Özet Bildiri)

11. A molecular portrait of retinoids and EZH2 inhibitors cooperation to orchestrate cytotoxic effects on bladder cancer cells

Özgün G., Yaraş T., Landman N., KARAKÜLAH G., van Lohuizen M., ŞENTÜRK Ş., et al.

The 47th FEBS Congress, 8 - 12 Temmuz 2023, cilt.13, (Özet Bildiri)

12. On-chip platform for derivation of ocular cells from hiPSCs

Kocak G., Uyulgan S., Polatli E., Sari V., Kahveci B., Bursali A., et al.

European Chapter of the Tissue-Engineering-and-Regenerative-Medicine-International-Society (TERMIS), Manchester, İngiltere, 28 - 31 Mart 2023, (Özet Bildiri)

13. Development of methods and tools in NPCs and zebrafish towards modeling of DNA sequence variants in patients with pachygyria by using genome editing technologies

Kuruoglu A., HIZ A. S., Cark O., Gencpinar P., Bora R. U., KARAKÜLAH G., et al.

55th European-Society-of-Human-Genetics (ESHG) Conference, Vienna, Avusturya, 11 - 14 Haziran 2022, cilt.31, ss.477-478, (Özet Bildiri)

14. Development of a pipeline for the analysis of the regulatory functions of transposable elements in accessible genomic regions

Eskier D., Yetkin S., Arslan N., Erkek S., ALOTAİBİ H., KARAKÜLAH G.

14. Türk Tıp Bilişimi Kongresi, İzmir, Türkiye, 16 - 18 Mart 2023, (Özet Bildiri)

15. Metabolomics analysis of iPSCs derived organoids

Sarı V., KOÇAK G., REÇBER T., KARAKÜLAH G., YILDIRIM C. A., NEMUTLU E., et al.

15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, Mersin, Türkiye, 20 - 21 Ekim 2022, (Özet Bildiri)

16. Transcriptomic profiling of induced pluripotent stem cell derived eye field cells

Kahveci B., KOÇAK G., YILDIRIM C. A., Mardinoğlu A., KARAKÜLAH G., GÜVEN S.

15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, Mersin, Türkiye, 20 - 21 Ekim 2022, (Özet Bildiri)

17. Investigating Partners in Crime: Osimertinib Resistance Mechanisms in Non-small Cell Lung Cancer Using Focused CRISPR Screen

Dayanç B., Eriş S., Çakıroğlu E., Mazı F. A., Coşkun Ö. Ş., Demirci D., et al.

IASLC 2022 WCLC World Conference on Lung Cancer, Vienna, Avusturya, 6 - 09 Ağustos 2022, cilt.17, ss.407, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

18. Genome-wide CRISPR screen identifies BUB1 as a cancer-dependency gene in malignant pleural mesothelioma

Cakiroglu E., Şentürk Ş., Karakülah G.

IUBMB-FEBS-PABMB 2022 Congress, Lisbon, Portekiz, 9 - 14 Temmuz 2022, cilt.12, ss.18, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

19. THE EFFECT OF HISTONE VARIANT H2A.Z-1 KNOCKDOWN IN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION

Yıldız Ş. N., Özkuru E., Kutlu N. K., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H., Dimitrov S.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey (MolBiyoKon’22), Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

20. Functional Analysis of Noncoding RNAs Critical to the Mesenchymal Epithelial Transformation Process

Özkan A., Eskier D., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

21. EPIGENETIC REGULATION OF EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION BY HISTONE VARIANT H3.3A

Özkuru E., Yıldız Ş. N., Kutlu N. K., KARAKÜLAH G., Dimitrov S., ALOTAİBİ H.

8th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey (MolBiyoKon’22), İstanbul, Türkiye, 9 - 12 Haziran 2022, (Özet Bildiri)

22. Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde Genetik Olmayan Osimertinib Direnç Mekanizmalarının CRISPR Tarama Aracılı Araştırılması

Uluata Dayanç B., Eriş S., Çakıroğlu E., Mazı F. A., Coşkun Ö. Ş., Demirci D., et al.

XVII. Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, İzmir, Türkiye, 28 - 31 Ekim 2021, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

23. P62.02 Identification of Essential Genes in Malignant Pleural Mesothelioma Using Genome-Wide CRISPR/Cas9-Based Negative Selection Screen

Çakıroğlu E., Coşkun Ö. Ş., KARAKÜLAH G., ŞENTÜRK Ş.

IASLC 2020 World Conference on Lung Cancer, Singapur, 28 - 31 Ocak 2021, cilt.16, ss.548, (Özet Bildiri)

24. INSAN MAKROFAJ POLARIZASYONUNDA YENI BIR MODÜLATÖR

Gunalp S., Helvacı D. G., Korkmaz A., Ünüvar Purcu D., Özbilgiç R., Karakülah G., et al.

XXV. Ulusal İmmünoloji Kongresi, İstanbul, Türkiye, 20 - 22 Kasım 2020, (Özet Bildiri)

25. TAP73ün Hepatoselüler Karsinomada Pro-tümörojenik Rolü

İŞCAN E., YILDIZ G., ÖZ Ö., EKİN U., KELEŞ U., KARAKÜLAH G., et al.

ONKOLOJİDE İZ BIRAKANLAR ZİRVESİ, Antalya, Türkiye, 14 - 17 Kasım 2019, (Özet Bildiri)

26. Hepatoselüler Karsinomanın Gelişiminde FAM134B: Dost Mu?, Düşman Mı?

KELEŞ U., KARAKÜLAH G., İŞCAN E., ERBAK YILMAZ H., SUNER KARAKÜLAH A., ÖZTÜRK M.

ONKOLOJİDE İZ BIRAKANLAR ZİRVESİ, Antalya, Türkiye, 14 - 17 Kasım 2019, (Özet Bildiri)

27. Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinde Epigenetik Yeniden Programlamayı Etkileyen Transkripsiyon Faktörlerinin Belirlenmesi

Şengez B., Arslan N., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

Onkolojide İz Bırakanlar Zirvesi, Türkiye, 14 - 16 Kasım 2019, ss.23, (Özet Bildiri)

28. Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecinin Epigenetik Altyapısını Düzenleyen Transkripsiyon Faktörlerinin Araştırılması

Şengez B., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

Hezarfen Uluslararası Fen Matematik ve Mühendislik Bilimleri Kongresi, İzmir, Türkiye, 8 - 10 Kasım 2019, ss.1007, (Tam Metin Bildiri)

29. Mezenkimal Epitelyal Dönüşüm Sürecini Düzenleyen Transkripsyon Faktörlerinin Epigenetik Yeniden Programlama Süreci Üzerindeki Etkilerinin Saptanması

Şengez B., Arslan N., KARAKÜLAH G., ALOTAİBİ H.

12. Tıp Bilişimi Kongresi, Ankara, Türkiye, 15 - 16 Kasım 2019, ss.30-36, (Tam Metin Bildiri)

30. HEPATOSELLÜLER KARSİNOMDA TGF-Β YANITININ HÜCRESEL MEKANİZMALARININ ARAŞTIRILMASI

DEMİRCİ D., ECE Ç., BENGİSU U. D., KARAKÜLAH G., ÖZTÜRK M., ŞENTÜRK Ş.

ONKOLOJİDE İZ BIRAKANLAR ZİRVESİ, Türkiye, 14 - 17 Kasım 2019, (Özet Bildiri)

31. TAp73’ün hepatoselüler karsinomada tümör teşvik edici rolü

İŞCAN E., YILDIZ G., Öz Ö., Ekin U., Khoury N., KELEŞ U., et al.

16. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi (Uluslararası Katılımlı), Muğla, Türkiye, 27 - 30 Ekim 2019, (Özet Bildiri)

32. Robust Gene Co-Expression Network Analysis

ALIN A., ÖLMEZ A., KARAKÜLAH G.

5th International Researchers, Statisticians and Young Statisticians Congress, 18 - 20 Ekim 2019, (Özet Bildiri)

33. Investigation of cellular mechanisms of TGF-beta resistance in hepatocellular carcinoma

Demirci D., Çakıroğlu E., KARAKÜLAH G., ÖZTÜRK M., ŞENTÜRK Ş.

3. Çukurova Hepatoselüler Karsinoma Kongresi, Adana, Türkiye, 21 - 23 Şubat 2019

34. Differential Network Analysis with Partial Least Square Regression

ALIN A., ÖLMEZ A., KARAKÜLAH G., SUNER KARAKÜLAH A.

11th International Statistics Days Conference (11th ISDC2018), Muğla, Türkiye, 3 - 07 Ekim 2018, (Özet Bildiri)

35. Identification and Annotation of Putative lncRNAs Involved in Mesenchymal-Epithelial Transition

ESKİER D., ŞENGEZ B., ALOTAİBİ H., KARAKÜLAH G.

MOLBİYOLKON 2018 - 6th Interational Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, 6 - 08 Eylül 2018, (Özet Bildiri)

36. Investigation of the Cellular Mechanisms of TGF--induced Senescence-Resistance in Hepatocellular Carcinoma

Demirci D., Çakıroğlu E., Bingöl B., KARAKÜLAH G., ÖZTÜRK M., ŞENTÜRK Ş.

6th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, 5 - 08 Eylül 2018

37. Differential network analysis on mouse brain parts using PLSR

ALIN A., ölmez a., KARAKÜLAH G., SUNER KARAKÜLAH A.

4th International Researchers, Statisticians and Young Statisticians Congress (IRSYSC 2018), 28 - 30 Nisan 2018, (Özet Bildiri)

38. Gene Co-Expression Network Analysis with Partial Least Square Regression

ÖLMEZ A., ALIN A., KARAKÜLAH G., SUNER KARAKÜLAH A.

COSTAS 2017 (International Conference on Computational and Statistical Methods in Applied Sciences) Kongresi, Samsun, Türkiye, 9 - 11 Kasım 2017, (Özet Bildiri)

39. Gene Co-Expression Network Analysis with Partial Least squares Regression

Ölmez A., ALIN A., KARAKÜLAH G., SUNER KARAKÜLAH A.

International Conference on Computational and Statistical Methods in Applied Sciences, Samsun, Türkiye, 9 - 11 Kasım 2017, (Özet Bildiri)

40. A Search for Common Pre-apoptotic Signals/Pathways in Mouse Models of Retinal Degeneration

Jiang C. K., Brooks M., Karakulah G., Gieser L., Kim J., Boleda A., et al.

Annual Meeting of the Association-for-Research-in-Vision-and-Ophthalmology (ARVO) - Imaging in the Eye, Maryland, Amerika Birleşik Devletleri, 6 - 11 Mayıs 2017, cilt.58, (Özet Bildiri)

41. De-novo assembly of mouse photoreceptor transcriptome identifies un-annotated IncRNAs regulated by NRL

Zelinger L., Karakulah G., Chaitankar V., Kim J., Yang H., Brooks M., et al.

Annual Meeting of the Association-for-Research-in-Vision-and-Ophthalmology (ARVO) - Imaging in the Eye, Maryland, Amerika Birleşik Devletleri, 6 - 11 Mayıs 2017, cilt.58, (Özet Bildiri)

42. Distinct Expression of Heat Shock Proteins in Mouse Models of Retinal Degeneration

Fairless E., Kooragayala K., Karakulah G., Kim J., Boleda A., Cogliati T., et al.

Annual Meeting of the Association-for-Research-in-Vision-and-Ophthalmology (ARVO), Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 1 - 05 Mayıs 2016, cilt.57, (Özet Bildiri)

43. RetSeq: Next Generation Sequencing Database for Exploring Retinal Development, Aging and Disease

Kaya K. D., Brooks M., Yang H., Kim J., Karakulah G., Swaroop A.

Annual Meeting of the Association-for-Research-in-Vision-and-Ophthalmology (ARVO), Colorado, Amerika Birleşik Devletleri, 3 - 07 Mayıs 2015, cilt.56, (Özet Bildiri)

44. Towards a Web-Based Decision Support Tool for Selecting Appropriate Statistical Test in Medical and Biological Sciences

SUNER KARAKÜLAH A., KARAKÜLAH G., DİCLE O.

25th European Medical Informatics Conference (MIE), İstanbul, Türkiye, 31 Ağustos - 03 Eylül 2014, cilt.205, ss.48-52, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma