-
2024 - Continues Baş boyun yassı hücreli karsinomu üç boyutlu in vitro ortamda DNA çift zincir kırıkları tamirini inhibe eden ve G2M duraklamasını önleyen ajanların dual radyoduyarlılaştırıcı etkisinin araştırılması
-
2024 - Continues Tümör anjiyogenezinin erken tanısına ilişkin yeni tanımlanan vasküler hasar biyobelirteçlerine nütrisyonel yaklaşım
-
2023 - 2025 Potansiyel Bir Ilaç Hedefi Olarak Mekanosensitif Iyon Kanalları Yoluyla Akış Basıncının Kolorektal Kanser Metastazına Etkisinin Sönümlenmesi
TUBITAK Project
Başbınar Y. (Executive), Ellidokuz H., Ellidokuz E. B., Işik Z., Çalıbaşı Koçal G.
-
2024 - 2024 Metastatik Kolorektal Kanserde FAK-Rho-ROCK Bağlantılı Sinyal Kaskadı İnhibisyonun Mekanobiyolojik Etkileri
-
2024 - 2024 247-C Stajyer Araştırmacı Burs Programı 122R090 NUMARALI PROJE KAPSAMINDA
-
2023 - 2024 Hipoksik tümör mikroçevresinde metforminin kanser hücrelerinin metabolik yeniden programlama adaptasyasyonuna etkisinin in vitro değerlendirilmesi
Research Project of the Presidency of Turkey Health Institutes (TÜSEB)
Bayrak S. (Executive), Başbınar Y., Bayrak Ö.
-
2023 - 2024 Kolorektal kanserde ekspresyonu artan TAM tirozin kinaz reseptör ailesi için in silico olarak belirlenen uygun inhibitör molekülün in vitro validasyon çalışması
Project Supported by Higher Education Institutions
BAŞBINAR Y. (Executive), SEYHAN S., SUCU S., BERRAK B.
-
2022 - 2024 TLR4 ve MSX1 İfade Artışına Bağlı Kolorektal Bölge Tümör Gelişimine Karşı Kemoinformatik Stratejiler Kullanılarak Aday İlaç Tasarımı ve İn vitro Doğrulanması
Research Project of the Presidency of Turkey Health Institutes (TÜSEB)
Başbınar Y. (Executive), Ellidokuz H., Ellidokuz E. B., Işık Z.
-
2022 - 2024 Eser Düzeydeki Kanser Metabolitlerinin Tayini İçin Elektrokimyasal Önderiştirme Tüplerinin Geliştirilmesi Ve Nefes Kondensatinda Biyobelirteç Analizlerine Uygulanmasi
-
2022 - 2024 Kolon kanserinde HDAC inhibitörü kullanımının kemoterapi etkinliğine etkisinin incelenmesi
Project Supported by Higher Education Institutions
ÇALIBAŞI KOÇAL G. (Executive), ELLİDOKUZ E. B., YILMAZ Ö. H., Kurter H., BAŞBINAR Y.
-
2021 - 2024 Üç Boyutlu Kolorektal Kanser Modelinde Bütirat ve Melatonin? in Kemoterapi Etkinliğindeki Rolü
Project Supported by Higher Education Institutions
ÇALIBAŞI KOÇAL G. (Executive), BAŞBINAR Y., Sever T.
-
2021 - 2024 Yeni Bir İlaç Hedefi Olarak Protein Devir Hızının (Ribozom - Proteazom Yolakları) Genomik Veri Tabanlarında Sorgulanması ve In-Silico Validasyonu ile Kliniğe Translasyonu
-
2021 - 2024 Yeni Bir İlaç Hedefi Olarak Protein Devir Hızının (Ribozom - Proteazom Yolakları) Genomik Veri Tabanlarında Sorgulanması ve In-Silico Validasyonu ile Kliniğe Translasyonu
Project Supported by Higher Education Institutions
Başbınar Y. (Executive), Ellidokuz E.
-
2021 - 2023 Epidermal Büyüme Faktörü Reseptörü (EGFR) Yolağıyla İlişkili, Eksozomal miRNA?ların, Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri (KHDAK) Olgularında Araştırılması
-
2020 - 2023 TUSEB-Peutz Jeghers Sendromu"",
Research Project of the Presidency of Turkey Health Institutes (TÜSEB)
Başbınar Y., Ellidokuz E. B. (Executive)
-
2020 - 2023 TUSEB-Çölyak hastalığı (Gluten enteropatisi)
-
2020 - 2023 Kanserde İmmunoterapi Etkinliğinin İyileştirilmesine Yönelik Makine Öğrenmesine Dayalı Yeni Gen Keşfi ve İlaç Yeniden Konumlandırma Platformunun Geliştirilmesi
-
2022 - 2022 Meme Kanseri Hücre Davranışında Sinir Büyüme Faktörü ve Sodyum Kanallarının Rolü
-
2020 - 2022 Transient Receptor Potential Vanniloid 4 (TRPV4) Kanalının Kolon Kanseri Metastazındaki Rolü
-
2020 - 2022 TUSEB-Mide Nöroendokrin Tümörleri
-
2020 - 2022 Ağ tabanlı bir sistem biyolojisi yaklaşımı ile kolorektal kanseri gelişiminde ve karaciğer metastazında etkili olan yolakların ve biyobelirteçlerin tespiti
Research Project of the Presidency of Turkey Health Institutes (TÜSEB)
Işık Z. (Executive), Başbinar Y., Ellidokuz E. B., Ellidokuz H.
-
2020 - 2022 Effect of combined use of Smo inhibitors and ptch1 inhibitors in hedgehog pathway on in vitro cell proliferation and invasion
-
2020 - 2022 Ağ-tabanlı bir sistem biyolojisi yaklaşımı ile kolorektal kanseri gelişiminde ve karaciğer metastazında etkili olan yolakların ve biyo-belirteçlerin tespiti
Project Supported by Higher Education Institutions
Ellidokuz E. B., Leblebici A., Koç A., Toksöz F., Başbınar Y., Ellidokuz H., et al.
-
2017 - 2022 Holographic Single Cell Imaging Technique Measuring the Change in the Structure of Cell Stiffness of Circulating Cancerous Cells (Ctcs) Using Quantitative Phase Imaging Method (Project no: 116E866)
-
2019 - 2021 Solunum Hastalıkları Alanında Translasyonel Tıp Yaklaşımı ile Yenilikçi Biyomedikal Cihazların Geliştirilmesi
-
2018 - 2021 Evaluation of the Synergistic Effect of Metformin and Dichloroacetate on Mitochondrial Energy Metabolism and Cetuximab Chemosensitivity in Oral Cavity Cancer: Drug Repositioning
-
2018 - 2021 Evaluation of hyperthermic intraperitoneal chemotherapy efficacy in a three-dimensional 'Microfluidic' in-vitro colorectal cancer peritoneal carcinomatosis model created with different cell lines.
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Ellidokuz H. (Executive), Başbınar Y.
-
2018 - 2021 Can Colorectal Cancer Organoids predict treatment targets in vitro? In vitro personalized organoid colorectal cancer model for the development of new treatments
Project Supported by Higher Education Institutions
Başbınar Y., Ellidokuz E. B. (Executive), Çalıbaşı Koçal G.
-
2017 - 2021 Akciğer kanserli hastaların bireye özgü moleküler tanı ve izleminde likit ve volatil biyopsinin kullanımı
-
2018 - 2020 Radyoterapi Direncinin Aşılmasına Yönelik Bireye Özgü Aktif Hedeflenmiş Yeni Bir Metal Nanopartikül İlaç Taşıyıcı Sistem Geliştirilmesi
-
2018 - 2020 Kanser hücrelerinin metastaz sürecinde fiziksel ve moleküler mekanizmaları (DEU BAP- 2018.KB.SAG.029)
-
2018 - 2019 The role of lactate dehydrogenase-related modification of tumor metabolism on chemotherapy efficacy in colorectal cancer.
-
2018 - 2019 Malign Melanom Fare Modelinde Anti Pd-1 Monoklonal Antikoru ve C Novyi-nt Intramural Uygulamasının Etkinliğinin Değerlendirilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions
Toksöz F., Ellidokuz H., Pakdemirli A., Başbınar Y. (Executive)
-
2018 - 2019 Malign Melanom Fare Modelinde Anti Pd-1 Monoklonal Antikoru ve C Novyi-nt Intramural Uygulamasının Etkinliğinin Değerlendirilmesi
-
2018 - 2019 ’Preklinik araştırmalarda anatomik, moleküler ve metabolik görüntüleme yöntemleri ile bilimsel altyapının geliştirilmesi
-
2017 - 2019 Larenks kanserlerinde anjiyogenetik ve hipoksik faktörlerin tümör davranışı üzerine etkileri
-
2017 - 2019 Malign melanom fare modelinde anti-PD-1 monoklonal antikoru ve c-novyi-nt intramural uygulamasının etkimliğinin değerlendirilmesi
-
2017 - 2019 Klinik örneklerde biyomarker profilinin belirlenmesi için 96 lık ince flim mikroözütleme çubuklarının geliştirilmesi ve üretimi
-
2017 - 2019 Ba? ve Boyun Kanser H?crelerinin Hipoksik Mikro?evresinde HIF-1alfa ile ?li?kili Mitokondriyal Glukoz Metabolizmas?n?n Rol?n?n ?ncelenmesi
Project Supported by Higher Education Institutions
Başbınar Y., , Ellidokuz H., Oktay G. (Executive)
-
2017 - 2019 Baş ve boyun kanser hücrelerinin hipoksik mikroçevresinde HIF-1alfa ile ilişkili mitokondriyal glukoz metabolizmasının rolünün incelenmesi
-
2015 - 2019 DEU BAP 2015 KBSAG 031 Hepatopankreatobilier kanserlerde büyüme faktörlerinin ve dolaşan kanser hücrelerinin prognozla ilişkisi
-
2015 - 2019 DEU BAP 2015 047 Metastatik HER2 pozitif meme kanserinde dolaşan tümör hücresi solubl HER2 reseptörü ve MUC4 ekspresyonunun prognostik rolü
-
2017 - 2018 Investigation of the presence of cfDNA in vaolatile condensate
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Başbınar Y. (Executive), Koç A.
-
2017 - 2018 Investigation of the effect of radicals in the tumor microenvironment on hypoxia-1 alpha regulated cell mechanisms and tumor behavior
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Ellidokuz H. (Executive), Başbınar Y.
-
2017 - 2018 N?roblastom 3D Modelllerinde normoksik/hipoksik mikro?evrenin hipoksia-1 alpha ?zerinden reg?le edilen h?cre mekanizmalar?na olan etkisi; Metabolamik yakla??m
Project Supported by Higher Education Institutions
Ellidokuz H., Çalıbaşı Koçal G., , Başbınar Y., Uysal Kılıç T., Olgun H. N. (Executive)
-
2017 - 2018 Effect of normoxic/hypoxic microenvironment on cell mechanisms regulated by hypoxia-1 alpha in neuroblastoma 3D models - Metabolomic approach
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Olgun H. N. (Executive), Başbınar Y.
-
2017 - 2018 Nöroblastom 3D Modelllerinde normoksik/hipoksik mikroçevrenin hipoksia-1 alpha üzerinden regüle edilen hücre mekanizmalarına olan etkisi; Metabolamik yaklaşım
-
2017 - 2018 Malign melanom fare modelinde intratümoral BCG ve anti-PD1 tedavi kombinasyonunun etkinliğinin değerlendirilmesi
-
2016 - 2018 SIEMENS HEALTHINEERS- THE IMPACT OF CIRCULATING TUMOR CELLS, SOLUBLE HER2 RECEPTOR AND MUC4 EXPRESSION ON PROGNOSIS OF METASTATIC HER2 POSITIVE BREAST CANCER
-
2015 - 2018 Ağız boşluğu ve larenks kanser hücre hatlarında radyterapi ile birlikte altın, gümüş ve platin nanotaşıyıcılarla kombine sisplatin etkinliğinin karşılaştırmalı incelenmesi
-
2015 - 2018 Akciger kanserinde tedavi izleminde likit biyopsi tabanli kit gelistirme
-
2015 - 2018 Over kanserinin periton metastazindaki rolu ve molekuler mekanizmalar
-
2015 - 2018 The Role and Molecular Mechanism of Peritoneal Natural Fluid Flow as a Component of the Physical Microenvironment in Peritoneal Metastasis of Ovarian Cancer (Project no: 214S334)
-
2017 - 2017 2017 KB SAG 003 3D invitro ko kültür modelinde osteosarkomTümör Mikroçevre İlişkisi
-
2016 - 2017 TPOG Prospective, Observatonal Nationwide Study on Pharmacogenomics/Genetics of Childhood Cancers in a Cohort of Turkish Pedıatric Oncology Group (TURKPEDPGx)
-
2016 - 2017 DEU BAP 2014 KBSAG 008 Türkiye Populasyonunda Çocukluk Çağı Solid Tümörlerinini Sağaltımında Kullanılan İlaçları Metabolize Edene Enzim Polimorfizmleri ve Hastalığın Etkin Yönetiminde Yardımcı Ulusal Protokollerin geliştirilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Ellidokuz H. (Executive), Başbınar Y. (Executive)
-
2015 - 2017 OVER KANSERLERİNDE, PERİTONEAL METASTAZ SÜRECİNDE MEZENKİMAL-EPİTELYAL TRANZİSYONUN MOLEKÜLER MEKANİZMASI
-
2015 - 2017 Kemoterapi adayı sisplatin yüklenmiş grafen tabanlı nano malzemeler
-
2015 - 2017 Oral kavite kanserlerinin tedavisinde sisplatin yüklenmiş grafen tabanlı nanomalzemelerle kombine edilen pulsed lazer hiperterminin etkisinin değerlendirilmesi bir invitro çalışma
-
2015 - 2017 DEU BAP 2015 KBSAG 017 Kolorektal Kanserlerde Metastatik Fenotipin Göstergesi Olarak Sialiltransferazların Rolü veKlinikopatolojik Özellikleri Yüksek Lisans Tezi
-
2015 - 2017 Osteosarcoma Tumor Microenvironment Relationship in 3D In vitro Co-Culture Models
-
2014 - 2017 INSERM-PRE-CLINICAL TRIAL TREATMENT OF HEPATOCELLULAR CARCINOMA ON CIRRHOSIS IN A RAT MODEL
-
2015 - 2016 Translasyonel bireye özgü bir tedavi modeli olarak dediferansiye kondrosarkomlarda in vitro ilaç direncinin nanopartikül bağlı hedeflenmiş moleküllerle aşılması
-
2015 - 2016 IDIBAPS-ZEB proteins and tumor progression. Role of ZEB1 and ZEB2 in oncogenic transformation, benign-malignant transformation and cancer cell proliferation and survival
Universities of Other Countries Supported Project
-
2014 - 2016 TUBİTAK 114S211 Türk Kıyılarındaki Denizhıyarlarından Antimetastatik Etki Gösteren Triterpen Glikozidlerin İzolasyonu
-
2014 - 2016 3Dinvitro ko-kültür modelinde osteosarkom tümör mikroçevre ilişkisi
-
2014 - 2015 STANFORD UNIVERSITY-Potential impact of physical microenvironment in post genomic processes which are controlled of colorectal cancer metastasis
Universities of Other Countries Supported Project
-
2014 - 2015 LMU-RAS EXPERT LABORATORY Quality Assurance of Molecular Pathologycal Detection of RAS mutation in Metastatik Colorectal Carcinomas 2014
-
2013 - 2015 HARVARD-BAMM Novel microchip technologies to develop microchips for cancer and related medical conditions
-
2012 - 2015 KOLOREKTAL KANSERLERDE METASTAZI KONTROL EDEN POTANSİYEL POST GENOMİK SÜREÇLER
-
2013 - 2014 Tükürük Sitokin Profilinin ve Genetik Özelliklerinin Diş Çürümelerine Yatkınlıktaki Rolü
-
2012 - 2014 Kişisel Genetik Bilgilerin Saklanması ve İşlenmesi İçin Veri Yapıları
-
2013 - 2013 İZTEK "Macpix temelli proteomik array kitleri için uygulama, validasyon süreçlerinin geliştirilmesi ve test sonuçlarının raporlanmasında istatistik ve biyoinformatik destek sisteminin oluşturulması
-
2013 - 2013 Polymorphic properties of enzymes that metabolize anticancer drugs
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Başbınar Y. (Executive), Ellidokuz H.
-
2012 - 2013 İZTEK Farmakogenomik Dataların Kanser Fenotipi ve Klinik Davranışlarına Etkisi İle Hastalık Yönetiminde Karar Desteklerinin Geliştirilmesi
-
2012 - 2013 DEU BAP 2012 KBSAG 085 Mide Kanseri Hastalarında Mikrosatellit İnstabilite EGFR ekspresyonu ve KRAS Mutasyonu Analizine Bakılması ve Bu Verilerin Klinikopatolojik Özelliklerle Korelasyonu
-
2012 - 2013 Determination of Dominant KRAS Mutation Type in Rectosigmoid Cancers of Aegean Region The Effect of Related Mutations on Protein Function and Drug Responses
-
2012 - 2013 Possible effects of phytochemicals on epigenetic aberrations and cell proliferation in laryngeal cancer cell lines.
-
2011 - 2013 A Methodological Approach in Bioinformatics Analysis of Multiple Analysis Data and Case Demographics
Project Supported by Higher Education Institutions
Çalıbaşı Koçal G., Ellidokuz H. (Executive), Başbınar Y.
-
2011 - 2013 DEU BAP 2011 KBSAG 034 Çoklu Analiz Verilerinin ve Olgu Demografiklerinin Biyoinformatik Analizinde Metodolojik bir Yaklaşım
-
2011 - 2013 DEU BAP 2010 KBSAG 006 cKIT Ekson 9 ve 11 Mutasyonlarının Gastrointestinal Stromal Tümörlerdeki Dağılımı
-
2009 - 2013 KALKINMA BAKANLIĞI 2007K120750 ALT YAPI PROJESİ DEÜ İleri Biyomedikal ARGE Merkezi Altyapı Projesi DPT
-
2009 - 2011 DEU BAP 2009 KBSAG 013 Kolon kanserinde yeni biyobelirteçler proteomik ve biyoinformatik yaklaşım
-
2009 - 2010 Clinical Significance of KIT mutations in Gastrointestinal Stromal Tumors
-
2009 - 2010 MHH-RING SEE KRAS VALIDATON TEST for Molecular-Patological Detection of KRAS Mutation in Colorectal Carcinoma 2010
-
2008 - 2010 DEU BAP 2008 Pseudomanas aeruginosa nın Quorum Sensing e Sahip ve Quorum Sensing den Yoksun Klinik Suşlarının Analizi Biyomarker Araştırması
-
2007 - 2009 RSHMB İzmir Hıfzıssıhha Enstitüsü "Diabetik hastalarda metabolik kontrol ve risk parametreleri, homeostatik mekanizmalar ve inflamatuar süreçlerin etkileri"
-
2007 - 2009 RSHMB İzmir Hıfzıssıhha Enstitüsü- İnfertilitede biyokimyasal değişiklikler
-
2007 - 2009 RSHMB İzmir Hıfzıssıhha Enstitüsü -Şişmanlığın Biyokimyasal Yapısı
-
2006 - 2006 RSHMB İZMİR HIFZISSIHHA ENSTİTÜSÜ Caulerpales Alglerinin Kanser Hücreleri Üzerine Olası Biyolojik Etkileri
-
2005 - 2005 DEUBAP 2003 KB SAG 001 İn vitro ortamda Erişkin ve Çocuk Kanserleri Sağaltım Modelinde Mikroçevrenin Apoptotik Yolak Üzerine Etkileri
-
2000 - 2001 MERCK Multiple Skleroz Olgularının Atak ve İyileşme Dönemleri Arasında Periferik ve Beyin Omurilik Sıvısı T Lenfositlerinin Ekspresyon Paternlerinin Mikroarray Yöntemi ile Karşılaştırılması
-
1995 - 1996 DEU BAP Tümör İnvazyonunun Çevre Bağ Dokusu ile İlişkisinde Kollajenin Yerinin Araştırılması
-
1994 - 1995 Aarhus University-Effects of extracellular matrix proteins on the protein phenotype of human epidermal keratinocytes
-
1994 - 1995 DEU BAP 1991 Ekstrasellüler Matriks Proteinleri Nidogen ve Fibronektin Moleküler yapılarının Biyolojik Fonksiyonlar Üzerine Etkileri Dokuz Eylül Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı
-
1991 - 1993 DEU BAP 1994 Tümör Belirleyicisi Olarak Elastazların ve Diğer Akut Faz Proteinlerinin Biyokimyasal ve Klinik Yönden İncelenmesi
Supported Projects
Supported Projects
Patent