Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp Ve Genom Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: ONUR ÖNDER
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Athanasia Pavlopoulou
Özet:
Bu
detaylı çalışma, histon varyantlarının kromozomal etkileşimler üzerindeki
etkilerini ve moleküler dinamik (MD) simülasyonlarının kanser
terapötiklerindeki potansiyelini araştırmaktadır. Başlangıçta, CENP-A
nükleozomlarının esnekliklerini kanonik H3 nükleozomlara kıyasla inceledik. Mg++
gibi iki değerlikli katyonların bu yapılar üzerindeki rolü, nükleozom
stabilitesi ve hücre bölünmesi sırasındaki kromozom segregasyonunu nasıl
etkilediğini aydınlatmaktadır. Ardından, CENP-C'nin CENP-A nükleozomları ve
kinetochore proteinleri ile etkileşimini inceledik. Moleküler dinamik
simülasyonları, histon varyantlarının bu etkileşimlerdeki rolünü
belirginleştirdi. Öne çıkan bir keşif, H2A.Z'nin CENP-A ve CENP-C arasındaki
bağlanmayı düzenleyerek ektopik kinetochore oluşumunu inhibe edebilmesiydi. Son
olarak, DNMT3A'nın rolü ve prokainin DNMT3A üzerindeki inhibitör etkisi
incelendi. Prokainin DNA metilasyonunu inhibe edebilme kapasitesi, kanserdeki
DNMT3A'nın rolü göz önüne alındığında, bu etkileşimin mekanizmasını anlamak
kritikti. Toplu olarak, bu çalışmalar kromozomal etkileşimlerin moleküler
dinamiklerini ve kanser tedavisi bağlamındaki etkilerini bütünsel bir şekilde
ele almaktadır