İnsan meme ve kolon karsinomu hücre hatlarının karyotipik ve moleküler sitogenetik karakterizasyonu


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2001

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: İLKNUR YILMAZ

Danışman: OĞUZ ALTUNGÖZ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

ÖZET Tümör hücrelerindeki genetik değişikliklerin kompleks ve heterojen yapıda oluşu, bu anomalilerin kanser hücreleri popülasyonunda tam olarak karakterize edilmesini, mikroskobik düzeydeki değişikliklerin moleküler temelinin anlaşılmasını ve bu olguların biyolojik süreçlerle ilişkilendirilmesini güçleştirmektedir. Bu çalışmada bir meme adenokarsinomu (MDA-MB-468) ve bir kolon adenokasinomu hücre hattının (SW-480) tam olarak karakterize edilmesi hedeflenmiştir. G-bantlama, komparatif genomik hibridizasyon (CGH), kromozom boyama kombine olarak kullanılmıştır. SW-480'de G-bantlamada literatürle benzer sonuçlar elde edilmesine karşın, marker kromozom olarak belirtilen bir kromozomun 18 no'lu kromozomun bir parçası olduğu, 18 no'lu kromozomun uzun kolunda kopya sayısı kaybı olduğu saptanmıştır. Aym hücre hatanda ins(7;?) olarak saptanan anomalinin, 7 no'lu kromozomun uzun kolunda belli segmentlerin amplifikasyonu olduğu CGH eğri profilleri ile saptanmıştır. Bu hücre hattının tam karyotipi: 57,X,+X,-Y,t(l;9) (q21;qll), +der(2)t(2;12) (q33;ql2), +der(3)del(3) (ql2), t(5;20) (ql5;pl2), +der(7)inv(7) (q22q36) t(7;14)(q22;q22),t(7;13)(q36;ql4),+7,der(8)t(8;?)(ql 1 ;?), +der(8) t(8;9) (qll;qll), der(10) t(3;10;12) (3qter->3q21::12ql4->12qll::10pl5-> 10qter),+ll, iso(12) (plO), +13, -14, +17,del(18) (ql2),der(19)add(19)(ql3),+der(20) t(5;20) (ql5;pl2), +20, +marl, +mar2 olacak şekilde belirlenmiştir. MDA-MB-468 hücre hatanda modal kromozom sayısının 59-61 olduğu saptanmıştır. Kromozom anomalileri çok kompleks olduğundan karyotip tam olarak çözümlenememiştir. Marker kromozomlarının yapısının belirlenmesinde CGH peek profili, wcp problanyla yapılan FISH deneylerinin verileri ve G-bantlama ile elde edilen karyotipik veriler ortak olarak değerlendirilmiştir. Ancak, kromozom anomalilerinin oldukça kompleks olması nedeni ile nomenklatür sistemine göre ayrıntılı karyotipik tanımlama yapılamamıştır. Tüm veriler biribirini destekler özelliktedir. Karyotip tam olarak çözümlenemediğinden, bu hücre hattının analizi CGH peek profilinden yola çıkılarak yapılmışlar. CGH peek profillerinde lp34-»qter, 2pl4->pter, 6q25-»pter, 7q21-»pter, 18qll.2-»pter bölgelerinde DNA kopya sayısı artışı; 3pl2-»pter, 5ql2-»q23, 18q bölgelerinde DNA kopya sayısı yitimi gözlenmiştir. Her iki hücre hattında da 18q'da yitim, 18p'de artış saptanmıştır. Anahtar kelimeler: Kolon Kanseri; Meme Kanseri; Sitogenetik; Moleküler Sitogenetik VI