A systems biology approach for the identification of gene expression signatures for cancer diagnosis, prognosis, and response to radiotherapy

---

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: HALİL İBRAHİM TOY

Danışman: Athanasia Pavlopoulou

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Kanser dünya çapında önde gelen ölüm nedenlerinden biridir. Antikanser tedavi yöntemlerinin mevcudiyetine rağmen, hem kanser insidansı ve prevalansı hem de mortalitesi halen yüksektir. Kanserin doğru teşhisi ve prognozu yanısıra hastaların antikanser tedavilerine yanıtlarının değerlendirilmesi klinik karar vermede kritik öneme sahiptir. Bu nedenle, kanserin erken teşhisi ve neticesi için güçlü moleküler belirteçlerin tanımlanmasına yönelik artan bir ihtiyaç bulunmaktadır. Bugüne kadar gösterilen örnek çabalara rağmen, insan kanserlerinde potansiyel tanısal, prognostik ve kanser tedavisine karşı dirençlilik sağlayan moleküler biyobelirteçleri belirlemek için kapsamlı çalışmalar halen yetersiz kalmaktadır. Önerilen çalışmalarımızın kapsamı, kamuya açık farklı kanser türlerine ait bibliyografik ve yüksek verimli verilerden faydalanılarak tanısal, prognostik ve radyo-direnç gen imzalarını belirlemektir. Bu amaçla, çeşitli kanser türlerinde sistematik incelemeler ve meta-analizler, gen ekspresyon profili oluşturma ve transkriptom çapında ilişkilendirme analizleri gibi bütünleştirici insiliko yaklaşımları uygulandı. Bu bulgular, kanserin doğru ve zamanında teşhisi, kanser hastalarının izlenmesi ve uygun antineoplastik tedavinin uygulanması için klinik ortamda potansiyel argümanlar olarak değerlendirilebilir.