New genomic approaches to explore the neurogenetic disease burden of consanguineous marriages in turkey
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2018
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: ELMASNUR YILMAZ
Danışman: YAVUZ OKTAY
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Akraba evlilikleri Türkiye'de yaygındır ve otozomal resesif kalıtımla artan genetik hastalık riski taşırlar. Bu durumların birçoğu, sinir sistemi ve kasları etkiler, bu da ciddi sakatlık veya erken ölümlere yol açar. Her bir nörogenetik vaka tek başına nadir olmasına rağmen, toplu bir şekilde ciddi bir sağlık ve ekonomik yük ile sonuçlanan yüzlerce nörogenetik vaka ile karşılaşılmaktadır. Türkiye'de nörogenetik rahatsızlığı olan çocukların çoğunda MRG, kapsamlı metabolik testler, kas biyopsileri ve genetik testler gibi tanı seçenekleri kullanılmış olmasına rağmen çoğunda kesin bir moleküler tanıya ulaşılamamıştır. Yeni nesil dizilemenin ilerlemesi, çocukluk çağındaki nörogenetik bozuklukların genetik nedenlerini daha iyi anlama, sonuçta birçok aile için kesin teşhis ve bazı durumlarda etkili tedavi fırsatı sunmaktadır. Genom dizilimi gün geçtikçe ekonomik olarak daha uygun hale gelmektedir. Yaygın olarak görülen Mendel hastalıklarına ve akraba evliliği sonucunda ortaya çıkmış nörogenetik hastalıklara yol açan nadir veya özel varyantların tanımlanması için de uygun hale gelmiştir. Bu çalışmada akraba evliliği sonucu ortaya çıkan nörogenetik hastalıklara neden olan varyantlar, akraba olan ailelerden gelen nörogenetik hastaların sistematik derin fenotiplemesi, tüm ekzom sekanslama ve uluslararası biyoenformatik platformlarındaki verilerin entegrasyonu ile tanımlandı. Tüm ekzom sekanslama ile çalışmaya katılan 138 aileden 62 aile sekanslama sonucunda tanılandı. Bu çalışma, önleme ve tedavi stratejilerinin geliştirilmesine, etkilenen aileler için iyileştirilmiş sonuçlara ve toplumla ilgili önemli bir genomik veri bilgi birikimine ve Türk tıp camiasında genom araştırmalarının artmasına yol açacaktır.