Akademik Veri Yönetim Sistemi
11. Onkolojide Arayışlar Sempozyumu, İzmir, Türkiye, 15 - 17 Aralık 2023, ss.14
Giriş: Pediatrik solid tümörler için gelişen yeni tedavi hedeflerine rağmen halen daha çok sayıda araştırmaya ihtiyaç duyulmaktadır. Özellikle yetişkin dönemde kullanılan hedefe yönelik ajanların pediatrik hastalarda kullanımı için solid tümörlerdeki mutasyonların detaylarıyla tespit edilmesi ve olası yan etki profillerinin açıklanması gibi oldukça hayati çalışmalar devam etmektedir. Nörotrofik tropomiyozin kinaz reseptörleri (NTRK veya TRK) ailesi, transmembran tirozin kinazların bir parçasıdır ve nöronal gelişimden sorumludur. NTRK genlerindeki değişiklikler nörojenik olan ve olmayan hücrelerde karsinogenezi tetikleyebilir. Solid tümörlerde nadir rastlanmakla birlikte NTRK mutasyonlarını hedefleyen yeni ajanlar klinikte kullanılmaya başlanmıştır. Ancak pediatrik tümörler için henüz yeterince çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amacı NTRK gen mutasyonlarının ve füzyonlarının insidansının pediatrik solid tümörlerde araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntem: 105 hastada NTRK1, NTRK2 ve NTRK3 genlerinde mutasyonların tespiti için yapılan sekanslamada; PILLAR™, OncoReveal-Multi-Cancer-V4 ve RNA Fusion Panel kiti kullanılmıştır. Parafine gömülü tümör dokusundan izole edilen DNA ve RNA’larda yeni nesil sekans analizi yapıldıktan sonra biyoinformatik analiz için FASTQ formatındaki veriler, Pivat platformunda değerlendirilmiştir. Eksonik olan ve popülasyonun %5'inden daha azında görülen SNV mutasyonlar seçildikten sonra kapsam için manuel olarak kontrol edilmiştir. Mutasyonların klinik anlamlılığı Clinvar’dan alınmıştır. Elde edilen veriler SPSS 28.0 ile analiz edilmiştir. Bulgular: Toplam 105 pediatrik solid tümör dokusundan yapılan çalışmada 57 hastada NTRK1, 8 hastada NTRK2 ve 8 hastada NTRK3 genlerinde mutasyon tespit edilmiştir. NTRK1 geninde 15 missense, 1 frameshift, 1 stop gain mutasyon, NTRK2 geninde 6 missense, 8 frameshift, 8 stop gain mutasyon, NTRK3 geninde 8 missense, 8 frameshift, 8 stop gain mutasyonları görülmüştür. En sık saptanan mutasyonlar, NTRK1’de, Q568R, L564P, NTRK2’de D640G, NTRK3’te K621R, L613F’dir. Füzyon çalışması sonunda NTRK1’de 5, ve NTRK3’te 9 füzyon görülmüştür. En sık saptanan füzyonlar NTRK3 için EML4(e2):NTRK3(e14) ve FAM131B(e2):NTRK3(e13), NTRK1 için TPR(e6):NTRK1(e5) füzyonlarıdır. Sonuç: Gelişen sekanslama tekniklerinin yardımıyla hedefe yönelik tedaviler hem yetişkin hem de pediatrik tümörlerde gün geçtikçe daha efektif olarak kullanılmaktadır. NTRK1, NTRK2 ve NTRK3 genleri için çeşitli mutasyonlar saptanmış olup, görülen mutasyonların karsinogenezdeki önemi ile ilgili daha detaylı çalışmalar yapılması gerekmektedir.
Anahtar Kelimeler: Pediatrik kanserler, NTRK gen mutasyonları, NGS