Akademik Veri Yönetim Sistemi
22. Ulusal Pediatrik Kanser Kongresi, Antalya, Türkiye, 8 - 12 Mart 2023, cilt.087, ss.231
Giriş: Nöroblastom,oldukça heterojen olup,yerleşim yeri,histopatoloji ve biyolojik özellikler açısından değişkenlik göstermektedir.Tümör
supresör genler, hücre büyümesine ve gelişmesine negatif yönde etki ederek proliferasyonu baskılayıcı bir etki göstermektedirler. Birçok
supresör gen; hücre döngüsünü inhibe eder ve hücreyi farklılaşmaya yönlendirir. Böylece apoptoz sürecini tetikleyerek hücrelerin kontrolsüz
çoğalmasını engeller.Tümör supresör genlerde meydana gelen mutasyonlar ile inaktivasyonlar, kanserin patogenezinde önemli bir
süreçtir. FBXW7 geni, 4q31q.3 bölgesinde yer alan bir tumor supresör gendir. FBXW7, Tüm kanserlerin %30 unda genin ifade edilmediği
bilinmektedir.Genin ifadesi, p53 aktivasyonu ardından artar ve sıklıkla çeşitli insan kanserlerinde alelik kayıp gösterir.Meme, kolorektal,
kolon, akciğer kanseri vb kanserler için FBXW7 geni incelenmiş olup literatürde nöroblastom ile ilgili yeterli veri yoktur. Bu çalışmanın
amacı nöroblastomda FBXW7 tümör supresör geninin klinik önemini araştırmaktır.
Gereç-Yöntem: 37 hastada FBXW7 mutasyonlarının tespiti için yapılan sekanslamada; PILLAR™,OncoReveal-Multi-Cancer-V4 kiti kullanılarak
incelenmiştir.Parafin bloklarda tümör dokusundan elde edilen DNA’lar sekanslandıktan sonra biyoinformatik analiz için FASTQ
verileri BAM dataya çevrilip Pivat platformunda değerlendirilmiştir.Tüm verileri yakalamak için hedef bölge okuma derinliği yüksek alınmıştır.
Eksonik olan ve popülasyonun %5’inden daha azında görülen SNV mutasyonlar seçildikten sonra kapsam için manuel olarak kontrol
edilmiştir. Mutasyonların klinik anlamlılığı Clinvar’dan alınmıştır. Elde edilen veriler SPSS 28.0 ile analiz edilmiştir.
Bulgular: Çalışmaya dahil olan 37 hastanın, 16’sı kız, 21’i erkektir. Yaş ortalaması 48±41,1 ay (7-36 ay)’dir. Tüm hastaların 29’u çeşitli
mutasyonlar içerirken, 8 hastada hiçbir mutasyon saptanmadı. En sık saptanan mutasyon, R689Q’dir. Olası patojen mutasyonlar R658Q,
R505C, R505H, R465C ve R479Q’dur. Bu mutasyonlar F-box bölgesindedir. Missense mutasyonlar 26 olguda saptandı. Üç olguda ise çerçeve
kayması mutasyonu olduğu gösterildi. Yapılan istatistiksel analizlerde, mutasyonlar ve cinsiyet, yaş, NMYC amplifikasyonları, 11q
delesyonu ile istatistiksel anlamlılık bulunmamıştır.
Sonuç: Nöroblastomda FBXW7 geninde 37 hasta içeren bu çalışmada çeşitli mutasyonlar saptanmış olup, bu mutasyonların klinik ilişkili
istatistiksel anlamlılığı tespit edilememiştir. Örneklem sayısının arttırılarak tespit edilen mutasyonların ana karsinogenez mekanizmasına
olan etkisi dolayısıyla klinik tabloya yansıması detaylarıyla incelenmelidir.