Akademik Veri Yönetim Sistemi
Aktaş S., Özer E. (Yürütücü), Altun Z. S., Olgun H. N., Serinan E., Aktaş T., et al.
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2023 - 2026
Çocukluk çağı kanserlerinin klinik onkolojik yönetiminde, tedaviye yanıtsız yüksek riskli olgulara
yönelik, immunoterapiler başta olmak üzere yeni tedavi modellerinin belirlenmesi, aynı zamanda
tedavinin yan etkisini azaltacak tedavi protokollerinin geliştirilmesi önemli araştırma konularıdır. Bu
projenin amacı sekanslama tabanlı genomik profilleme yöntemlerini kullanarak pediatrik tümörlere
özgü genomik değişikliklerini saptamak, bu değişikliklerin biyobelirteç olarak önemini ortaya koymak
ve bu bağlamda immunoterapi tedavi modellerinin gelişimine katkı vermektir. Çalışmanın ilk
evresinde 1900 nöroblastom olgusuna ait klinik veriler toplanarak risk durumlarına göre
stratifikasyon yapılacaktır. Daha sonra seçilen olgulara ait tümör dokularından ekstrakte edilen DNA
ve RNA materyallerinde genomik profilleme amaçlı tüm ekzom ve transkriptom sekanslaması
gerçekleştirilecektir. Bununla beraber eş zamanlı olarak tümörlerden hazırlanan doku kesitlerinde
spatiyal transkriptomik sekanslama yapılarak, tümör ve mikroçevre hücreleri arasında
interaksiyonlar ve tek hücre genomik değişiklikleri saptanacaktır. Projenin sonuçlarının
değerlendirilmesi ile genomik imza niteliğinde değişiklikler belirlenerek, bu değişikliklerin biyobelirteç
olarak validasyonu yapılacaktır. Bu amaçla ek immunohistokimyasal yöntemler kullanılacaktır.
Çalışmamızın ikinci evresinde birinci evrede elde ettiğimiz deneyim ve çıktıların ışığında,
hastanemizde tanı ve tedavi gören diğer çocukluk çağı kanserlerinden Hodgkin lenfoma, pediatrik
beyin kanserleri ve Langerhans hücreli histiyositoz olgularında aynı amaç ve hedefleri içeren
genomik profilleme yapılacaktır.