Türk toplumunda görülen nadir bir nörogenetik hastalık için knockin fare modeli geliştirilmesi ve temel fenotipik karakterizasyonu: TRAPPC4 mutasyonu


Esmen K., Diril M. K. (Yürütücü)

TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi, 2024 - 2025

  • Proje Türü: TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi
  • Başlama Tarihi: Temmuz 2024
  • Bitiş Tarihi: Temmuz 2025

Proje Özeti

Van Bergen et al. (2020), patolojik bir TRAPPC4 varyantı nedeniyle oluşan otozomal resesif kalıtsal özelliğe sahip nadir görülen bir genetik hastalığı ilk defa tanımlamışlardır. Yüksek oranda korunmuş bir splays bölgesinde tek bir nükleotidde değişime sebep olan mutasyon, etkilenen hastalarda gelişimsel gecikme, spastisite ve beyin atrofisine neden olmakta. Şimdiye kadar patolojik TRAPPC4 aleli için bir fare modeli oluşturulmamıştır. Böyle bir hayvan modeli, hastalık etiyolojisi ve hastalığın moleküler mekanizması hakkındaki anlayışımızı büyük ölçüde artıracaktır. Bu nedenle, bu nadir görülen genetik hastalık için CRISPR-EZ yöntemini kullanarak bir fare modeli oluşturmaya karar verdik. Ön çalışmalarımızda knockin mutasyonunu taşıyan founder fareler elde ettik. Projede yapacağımız çalışmalar ile ürettiğimiz knockin farelerin TRAPPC4 patolojisini ne ölçüde modellediğini göstermek istiyoruz. Sanger sekans analizi ile mutasyonun konfirmasyonu ardından bir fare kolonisi kurulacaktır. Knockin farelerdeki mutasyonun TRAPPC4 RNA ve protein ekspresyonunu nasıl etkilediği araştırılacaktır. Homozigot knockin fareler ve embriyolar histopatalojik olarak incelenerek, sonuçlar, hastalarda görülen klinik bulgular ile kıyaslanacaktır.