İzmir ve Çevresinde İshalli Hayvanlarda Rotavirus Etkenlerinin Tespiti, Sınıflandırılması, G ve P Genotip Kombinasyonlarının Nispi Dağılımının Araştırılması


Bulut O.(Yürütücü), Bulut Z., Dinçer E., Dik I., Nayir M. B., Uyunmaz Saklı G., et al.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2024 - 2026

  • Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  • Başlama Tarihi: Şubat 2024
  • Bitiş Tarihi: Şubat 2026

Proje Özeti

Bu çalışmada İzmir ve çevresinde sirküle olan sığır rotavirus etkenlerinin tespiti için özellikle 0-1 aylık ishal semptomlarına sahip yaklaşık 300 adet buzağıdan dışkı örnekleri toplanacaktır. Örnekler usulüne uygun olarak hazırlandıktan sonra Bovine Rotavirus etkeninin belirlenmesi amacıyla önce Konvansiyonel PCR metodu ile genel tanımlayıcı proteini olan VP6 bölgesi amplifiye edilecektir. Ardından pozitif olarak belirlenen örnekler uygun olarak seçilen primerler vasıtasıyla G ve P genotiplendirme işlemine tabi tutulacaktır.

Diğer taraftan pozitif olarak bulunan ve genotiplendirmesi yapılan örnekler usulüne uygun bir şekilde hazırlandıktan sonra süpernatant kısımları Rotaviruslar için duyarlı olan MA-104 hücre kültürlerine adsorbsiyonlu ekim tekniğine uygun olarak inokule edilecektir. En az 5 kez kör pasajı yapılan örnekler Rotavirus için CPE’ler bakımından incelenerek CPE gözlenen örnek izolatları ileride yapılacak aşı projelerine kaynak oluşturması amacıyla -80°C’de saklanacaktır.