Anne sütündeki patojenlerin DNA düzeyinde tayini için CRISPR temelli biyosensör geliştirilmesi


Ertuğrul Uygun H. D. (Yürütücü)

TÜBİTAK Projesi, 2218 - Yurt İçi Doktora Sonrası Araştırma Burs Programı, 2022 - 2024

  • Proje Türü: TÜBİTAK Projesi
  • Destek Programı: 2218 - Yurt İçi Doktora Sonrası Araştırma Burs Programı
  • Başlama Tarihi: Haziran 2022
  • Bitiş Tarihi: Haziran 2024

Proje Özeti

Anne sütü bebek beslenmesi için hayati önem taşıyan bir besin kaynağıdır. Ancak anne sütüne ulaşmada ortaya çıkabilen bazı engeller sonucu, anne ve bebeğin kontamine olmamış anne sütüne erişmesi için anne sütü bankaları ortaya çıkmıştır. Bağışlanan anne sütünün içeriğinin kontrolü için uygulanan yöntemler hem zaman alıcı hem de maliyetlidir. Bu nedenle anne sütünde patojenlerin hızlı, güvenilir tayini için, bir biyotanıma ajanı ve bir elektrotun bir araya gelmesi ile geliştirilen elektrokimyasal biyosensörler alternatif bir yöntem olabilir. Bu proje kapsamında, patojen bakterilerin genomik düzeyde tayini ile hangi bakteri ile sütün enfekte olduğu süt içerisinde bulunan ekstraselüler veziküllerin içeriğinde bulunan DNA ile tayin edilebilecektir. Geliştirilecek biyosensör CRISPR-Cas9 sistemi biyotanıma ajanı olarak kullanılacaktır. Bu çalışmada kesme aktivitesi olmayan sadece tanıma kapasitesi olan deaktive Cas9(dCas9) proteinleri kullanılacaktır. dCas9 proteinin patojen DNA’sına bağlanması elektrokimyasal impedans spektroskopisi (EIS) ile ölçülerek, DNA’yı seçici olarak bağlama kapasitesi olan CRISPR teknolojisinin kullanımı ile son derece duyarlı EIS temelli bir biyosensör sistemi geliştirilecektir.