TAF7 ekspresyonunun sirna ile baskılanması sonrasında apoptotik süreçteki değişikliklerin araştırılması

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Dokuz Eylül Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2007

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: DİLEK GÖKTÜRK

Danışman: ZEYNEP YÜCE

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

HIV enfeksiyonunun biyoloji ve immunopatogenezini anlamak, terapötik stratejilerinve profilaktik aşıların geliştirilmesinde büyük önem taşımaktadır. HIV genomundaki 9 gendenbiri olan Tat, gen ekspresyonu için gerekli olup işlevlerini üç başlık altında toplayabiliriz: 1)Proviral genlerin transkripsiyonel transaktivasyonu, inisiyasyon ve elongasyon süreçlerinidesteklemek 2) Kimi konak hücre genlerinin ekspresyonlarını özellikle pre-inisiyasyonkompleks yapısını bozarak transkripsiyon düzeyinde baskılamak 3) Konak hücrelerdeapoptozu tetiklemek.Genel transkripsiyon faktörü TFIID'nin yapısında yer alan TAF7 geninin HIV Tat' ınökaryotik işlevsel homoloğu olduğu ileri sürülmüştür. TAF7, HIV Tat proteinine benzerşekilde elongasyonu destekleme veya transkripsiyonu baskılayabilme özelliklerinibarındırmaktadır. Ancak HIV Tat gibi programlanmış hücre ölümünde rolü olup olmadığıaraştırılmamıştır.Apoptoz yolaklarının tanımlanması büyük önem taşımaktadır. Fakat apoptoz sürecininparçası olan genel transkripsiyonun baskılanma mekanizması bilinmemektedir. Hipotezimiz,bir apoptoz bulgusu olan transkripsiyon durdurulmasının TAF7 üzerinden gerçekleştiğiyönündedir. Bunu test etmek amacıyla radyasyon, etoposit ve MGBG apoptotik uyarılarınıalan hücre kültürlerinde siRNA oligonükleotidleri kullanılarak TAF7'nin ekspresyonunubaskılanıp, apoptotik cevapları ölçüldü. TAF7 ekspresyonu baskılanan HeLa ve Kelly hücrehatlarında radyasyon, etoposit ve MGBG uygulamaları karşısında apoptotik davranışınkontrol grubu hücrelerine göre 4-6 kat azaldığı gözlendi. TAF7 over-ekspresyonu yaptığımızçalışmalarda, hücrelerde HIV Tat'a benzer şeklide mikrotübül stabilizasyonu yoluylaapoptozu tetiklediğini gösterdik. Ayrıca viral ekspresyonlarda interferon uyarımına cevabenprotein düzeyi artan CTIIA'in, HIV Tat proteini ile olduğu gibi TAF7 ile de ilişkili olduğunuimmün presipitasyon deneyleri ile gösterdik.Sonuç olarak TAF7'nin apoptotik süreçte rol aldığı ve apoptozun genel transkripsiyonmekanizması ile ilişkili olduğu ilk kez gösterilmiştir. TAF7'nin, HIV Tat proteini ile olanişlevsel benzerliklerinin farklı alanlarda gösterilmesi HIV araştırmalarına büyük katkısağlayacaktır.